En raison de l'augmentation des attributions, compétences et autres missions, et surtout des attentes des Institutions et du public, la Chambre des Comptes doit à court ou moyen terme relever certains défis et tracer des perspectives.

S'agissant des défis, la Chambre des Comptes doit :

·       disposer d'un immeuble Siège selon les standards internationaux propres aux juridictions financières ;

·       maitriser les techniques et arcanes de la certification des Comptes de l'Etat à travers le contrôle de la comptabilité générale, le contrôle budgétaire, le contrôle de performance par une meilleure appropriation de la comptabilité analytique, le contrôle prévisionnel au moyen de la centrale des bilans :

·       renforcer ses capacités opérationnelles à l'exercice de toutes ses missions.

Les perspectives de la Chambre des Comptes quant à elles, s'inscrivent dans :

·       la relecture de la loi n° 2003/005 du 21 avril 2003 pour l'arrimer aux dispositions de l'article 72 de la Directive n° 01/11-UEAC-190-CM-22 relative aux lois de Finances et de lui conférer le Statut d'Institution Supérieure de Contrôle ;

·       rendre public les rapports transmis au Parlement et ou Gouvernement ;

·       publier les décisions particulières dans le Journal Officiel et dans deux grands journaux de grande diffusion :

·       organiser le suivi de ses recommandations et la publication des résultats de ce suivi ;

·       mettre en place les Tribunaux Régionaux des Comptes